故事内容延续第一部TV版《攻壳机动队 STAND ALONE COMPLEX》的剧情继续发展。但TV版的2部作品与剧场版无甚联系，可以看做是两个平行世界里发生的事情。这次TV版第2季的制作班底与第一部相同，同时剧情表达上和第一季一样，每话由不同故事构成，各自独立成章，却贯穿着同一条主线。在剧情上同时电影版导演押井守也参与了协力，不过电影版中凄凉的气氛没有在TV版第二季中体现。
《植物僵尸萌趣日常》采用清新可爱的卡通画风，延续经典游戏 IP 的欢乐氛围。没有紧张激烈的对战冲突，更多展现植物与僵尸之间呆萌搞笑的日常互动，时而互相捉弄，时而意外联手化解小麻烦。每一集都充满脑洞大开的趣味情节，角色形象可爱讨喜，画面明快活泼。整体风格轻松治愈、笑点满满，在欢乐温馨的氛围里，呈现出植物与僵尸之间别样又治愈的趣味日常。
